سیدمجتبی هاشمی در سال ١٣٥٩ گروه ضربتی به نام گروه «فداییان اسلام» را تشکیل داد. پس از شروع جنگ تحمیلی، ستاد این گروه در هتل کاروانسرای آبادان شکل گرفت و او و همرزمانش، در مقاومت ۳۲ روزه این شهر، با امیر سرتیپ منوچهر کهتری ایستادگی کردند.