به گزارش قائم آنلاین،  یکی از مهمترین تقابل های آخوندی در دوران وزارت خود، بروز مشکلات مختلف با فرج الله رجبی رئیس سازمان نظام مهندسی ساختمان کشور در حوزه وظایف نظام مهندسی بود که این مشکلات در یک سال و نیم اخیر و همزمان با آغاز ابلاغ چند دستورالعمل جدید در راستای اصلاح برخی عدم شفافیت